MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 65922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015945	TTCTT	2	10	170641	170650	0 %	80 %	0 %	20 %	344201499
3002	NC_015945	ATA	2	6	170725	170730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201499
3003	NC_015945	ATC	2	6	170808	170813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201499
3004	NC_015945	CCT	2	6	171064	171069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201499
3005	NC_015945	TCT	2	6	171154	171159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201499
3006	NC_015945	CAT	2	6	171293	171298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201499
3007	NC_015945	CAA	2	6	171309	171314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201499
3008	NC_015945	TTCT	2	8	171368	171375	0 %	75 %	0 %	25 %	344201499
3009	NC_015945	T	7	7	171383	171389	0 %	100 %	0 %	0 %	344201499
3010	NC_015945	CAG	2	6	171611	171616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201500
3011	NC_015945	CTG	2	6	171656	171661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201500
3012	NC_015945	TTG	2	6	171663	171668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201500
3013	NC_015945	TGT	2	6	171748	171753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201500
3014	NC_015945	TCC	2	6	171765	171770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201500
3015	NC_015945	TGC	2	6	171859	171864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201500
3016	NC_015945	TAA	2	6	171874	171879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201500
3017	NC_015945	TCA	2	6	171880	171885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201500
3018	NC_015945	ATA	2	6	171952	171957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201500
3019	NC_015945	TGT	2	6	172039	172044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201500
3020	NC_015945	CCA	2	6	172072	172077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201500
3021	NC_015945	CTT	2	6	172136	172141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201500
3022	NC_015945	CCA	2	6	172175	172180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201500
3023	NC_015945	CGC	2	6	172229	172234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201500
3024	NC_015945	AC	3	6	172260	172265	50 %	0 %	0 %	50 %	344201500
3025	NC_015945	T	7	7	172266	172272	0 %	100 %	0 %	0 %	344201500
3026	NC_015945	GTTC	2	8	172304	172311	0 %	50 %	25 %	25 %	344201500
3027	NC_015945	AGT	2	6	172313	172318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201500
3028	NC_015945	TGA	2	6	172343	172348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201500
3029	NC_015945	TCAAC	2	10	172364	172373	40 %	20 %	0 %	40 %	344201500
3030	NC_015945	GATT	2	8	172393	172400	25 %	50 %	25 %	0 %	344201500
3031	NC_015945	A	6	6	172402	172407	100 %	0 %	0 %	0 %	344201500
3032	NC_015945	CTT	2	6	172466	172471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201500
3033	NC_015945	CAA	2	6	172521	172526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201500
3034	NC_015945	TTC	2	6	172666	172671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201500
3035	NC_015945	CAA	2	6	172679	172684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201500
3036	NC_015945	TTCA	2	8	172737	172744	25 %	50 %	0 %	25 %	344201500
3037	NC_015945	ACAATA	2	12	172773	172784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	344201500
3038	NC_015945	AACC	2	8	172828	172835	50 %	0 %	0 %	50 %	344201500
3039	NC_015945	CTA	2	6	173487	173492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201501
3040	NC_015945	GTT	2	6	173517	173522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201501
3041	NC_015945	TTTTG	2	10	173539	173548	0 %	80 %	20 %	0 %	344201501
3042	NC_015945	AGG	2	6	173578	173583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201501
3043	NC_015945	AAGG	2	8	173585	173592	50 %	0 %	50 %	0 %	344201501
3044	NC_015945	T	6	6	173645	173650	0 %	100 %	0 %	0 %	344201501
3045	NC_015945	TAT	2	6	173755	173760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201501
3046	NC_015945	ATTA	2	8	173794	173801	50 %	50 %	0 %	0 %	344201501
3047	NC_015945	TTA	2	6	173831	173836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201501
3048	NC_015945	CGC	3	9	173850	173858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201501
3049	NC_015945	TCCAAT	2	12	173864	173875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201501
3050	NC_015945	TTG	2	6	174029	174034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201501
3051	NC_015945	GGT	2	6	174160	174165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201501
3052	NC_015945	AGT	2	6	174198	174203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201501
3053	NC_015945	CTG	2	6	174216	174221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201501
3054	NC_015945	GGTA	2	8	174336	174343	25 %	25 %	50 %	0 %	344201501
3055	NC_015945	ATC	2	6	174355	174360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201501
3056	NC_015945	CATT	2	8	174390	174397	25 %	50 %	0 %	25 %	344201501
3057	NC_015945	TCA	2	6	174471	174476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201501
3058	NC_015945	ATCT	2	8	174481	174488	25 %	50 %	0 %	25 %	344201501
3059	NC_015945	CAA	2	6	174556	174561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201501
3060	NC_015945	A	6	6	174589	174594	100 %	0 %	0 %	0 %	344201501
3061	NC_015945	TAT	2	6	174612	174617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201501
3062	NC_015945	GCC	2	6	174659	174664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201501
3063	NC_015945	TTC	2	6	174706	174711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201501
3064	NC_015945	TCA	2	6	174743	174748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201501
3065	NC_015945	TGG	2	6	174988	174993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201501
3066	NC_015945	CTT	2	6	175020	175025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201501
3067	NC_015945	TA	3	6	175026	175031	50 %	50 %	0 %	0 %	344201501
3068	NC_015945	ATCCA	2	10	175033	175042	40 %	20 %	0 %	40 %	344201501
3069	NC_015945	T	7	7	175065	175071	0 %	100 %	0 %	0 %	344201501
3070	NC_015945	TTC	2	6	175082	175087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201501
3071	NC_015945	ATG	2	6	175100	175105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201501
3072	NC_015945	CTT	2	6	175134	175139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201501
3073	NC_015945	AGCC	2	8	175182	175189	25 %	0 %	25 %	50 %	344201501
3074	NC_015945	TGC	2	6	175264	175269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201501
3075	NC_015945	CTT	2	6	175272	175277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201501
3076	NC_015945	CCA	2	6	175395	175400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201501
3077	NC_015945	ATG	2	6	175490	175495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201501
3078	NC_015945	AAG	2	6	175587	175592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201501
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3080	NC_015945	TAA	2	6	175644	175649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201501
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3082	NC_015945	TTC	2	6	175791	175796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201502
3083	NC_015945	TTGGAT	2	12	175802	175813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	344201502
3084	NC_015945	CCAA	2	8	175886	175893	50 %	0 %	0 %	50 %	344201502
3085	NC_015945	CTC	2	6	175917	175922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201502
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3087	NC_015945	AATG	2	8	176006	176013	50 %	25 %	25 %	0 %	344201502
3088	NC_015945	TGGA	2	8	176099	176106	25 %	25 %	50 %	0 %	344201502
3089	NC_015945	CCT	2	6	176117	176122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201502
3090	NC_015945	ATC	2	6	176446	176451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201503
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3092	NC_015945	GCG	2	6	176543	176548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201503
3093	NC_015945	CAA	2	6	176571	176576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201503
3094	NC_015945	TTC	2	6	176686	176691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201503
3095	NC_015945	CAT	2	6	176748	176753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201503
3096	NC_015945	TAT	2	6	176754	176759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201503
3097	NC_015945	CATCC	2	10	176799	176808	20 %	20 %	0 %	60 %	344201503
3098	NC_015945	AGA	2	6	176883	176888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201503
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3100	NC_015945	CT	3	6	176904	176909	0 %	50 %	0 %	50 %	344201503
3101	NC_015945	TCC	2	6	176948	176953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201503
3102	NC_015945	TCA	2	6	176960	176965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201503
3103	NC_015945	TGA	2	6	176978	176983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201503
3104	NC_015945	CTT	2	6	176991	176996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201503
3105	NC_015945	TGAGA	2	10	177034	177043	40 %	20 %	40 %	0 %	344201503
3106	NC_015945	TTG	2	6	177065	177070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201503
3107	NC_015945	CAT	2	6	177075	177080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201503
3108	NC_015945	TGT	2	6	177099	177104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201503
3109	NC_015945	A	6	6	177639	177644	100 %	0 %	0 %	0 %	344201504
3110	NC_015945	T	6	6	177660	177665	0 %	100 %	0 %	0 %	344201504
3111	NC_015945	T	8	8	177679	177686	0 %	100 %	0 %	0 %	344201504
3112	NC_015945	ATG	2	6	177729	177734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201504
3113	NC_015945	T	6	6	177757	177762	0 %	100 %	0 %	0 %	344201504
3114	NC_015945	TTC	2	6	177850	177855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201504
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3117	NC_015945	CATA	2	8	178001	178008	50 %	25 %	0 %	25 %	344201504
3118	NC_015945	ATT	2	6	178222	178227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201504
3119	NC_015945	ACA	2	6	178231	178236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201504
3120	NC_015945	TGGA	2	8	178257	178264	25 %	25 %	50 %	0 %	344201504
3121	NC_015945	TGC	2	6	178388	178393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201504
3122	NC_015945	CCA	2	6	178399	178404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201504
3123	NC_015945	GGT	2	6	178493	178498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201504
3124	NC_015945	GAA	2	6	178504	178509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201504
3125	NC_015945	AAT	2	6	178524	178529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201504
3126	NC_015945	TACC	2	8	178544	178551	25 %	25 %	0 %	50 %	344201504
3127	NC_015945	A	7	7	178565	178571	100 %	0 %	0 %	0 %	344201504
3128	NC_015945	AC	3	6	178604	178609	50 %	0 %	0 %	50 %	344201505
3129	NC_015945	CTT	2	6	178640	178645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201505
3130	NC_015945	ATAC	2	8	178665	178672	50 %	25 %	0 %	25 %	344201505
3131	NC_015945	AAG	2	6	178817	178822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201505
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3135	NC_015945	ATGC	2	8	179024	179031	25 %	25 %	25 %	25 %	344201505
3136	NC_015945	A	6	6	179208	179213	100 %	0 %	0 %	0 %	344201505
3137	NC_015945	GTAAT	2	10	179300	179309	40 %	40 %	20 %	0 %	344201505
3138	NC_015945	AGTAA	2	10	179512	179521	60 %	20 %	20 %	0 %	344201505
3139	NC_015945	TGA	2	6	179535	179540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201505
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3142	NC_015945	CAT	2	6	179790	179795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201505
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3144	NC_015945	AATT	2	8	179855	179862	50 %	50 %	0 %	0 %	344201505
3145	NC_015945	GCA	2	6	179932	179937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201505
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3148	NC_015945	ACTA	2	8	180136	180143	50 %	25 %	0 %	25 %	344201506
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3154	NC_015945	T	6	6	180496	180501	0 %	100 %	0 %	0 %	344201506
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3223	NC_015945	T	7	7	184752	184758	0 %	100 %	0 %	0 %	344201513
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3229	NC_015945	ATA	2	6	184969	184974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201513
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3231	NC_015945	CTT	3	9	185032	185040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201513
3232	NC_015945	T	6	6	185160	185165	0 %	100 %	0 %	0 %	344201513
3233	NC_015945	AAAC	2	8	185242	185249	75 %	0 %	0 %	25 %	344201513
3234	NC_015945	TCC	2	6	185268	185273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201513
3235	NC_015945	TAA	2	6	185388	185393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201513
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3237	NC_015945	TCA	2	6	185493	185498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201513
3238	NC_015945	CAT	2	6	185653	185658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201513
3239	NC_015945	ACA	2	6	185695	185700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201513
3240	NC_015945	T	6	6	185921	185926	0 %	100 %	0 %	0 %	344201513
3241	NC_015945	AAT	2	6	185972	185977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201513
3242	NC_015945	TTC	2	6	186053	186058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201513
3243	NC_015945	T	7	7	186319	186325	0 %	100 %	0 %	0 %	344201513
3244	NC_015945	GTT	2	6	186353	186358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201513
3245	NC_015945	ACC	2	6	186410	186415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201513
3246	NC_015945	TCA	2	6	186421	186426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201513
3247	NC_015945	GGT	2	6	186482	186487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201513
3248	NC_015945	GTC	2	6	186527	186532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201513
3249	NC_015945	TCC	2	6	186713	186718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201513
3250	NC_015945	GTA	2	6	186794	186799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201513
3251	NC_015945	CAT	2	6	186823	186828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201513
3252	NC_015945	TG	3	6	186835	186840	0 %	50 %	50 %	0 %	344201513
3253	NC_015945	CAAT	2	8	186955	186962	50 %	25 %	0 %	25 %	344201513
3254	NC_015945	CCT	2	6	187026	187031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201513
3255	NC_015945	CAC	2	6	187042	187047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201513
3256	NC_015945	GCG	2	6	187070	187075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201513
3257	NC_015945	GCA	2	6	187089	187094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201513
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3259	NC_015945	GTC	2	6	187191	187196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201513
3260	NC_015945	AGT	2	6	187493	187498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201513
3261	NC_015945	GGT	2	6	187580	187585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201513
3262	NC_015945	TCC	2	6	187592	187597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201513
3263	NC_015945	GCTTT	2	10	187691	187700	0 %	60 %	20 %	20 %	344201513
3264	NC_015945	TTG	3	9	187996	188004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201514
3265	NC_015945	TCA	2	6	188077	188082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201514
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3267	NC_015945	A	7	7	188169	188175	100 %	0 %	0 %	0 %	344201514
3268	NC_015945	AGA	2	6	188231	188236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201514
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3271	NC_015945	TGT	2	6	189420	189425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201515
3272	NC_015945	TTC	2	6	189534	189539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201515
3273	NC_015945	TTCT	2	8	189550	189557	0 %	75 %	0 %	25 %	344201515
3274	NC_015945	TTC	2	6	189636	189641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201515
3275	NC_015945	T	6	6	189654	189659	0 %	100 %	0 %	0 %	344201515
3276	NC_015945	ATC	2	6	189667	189672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201515
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3279	NC_015945	TCG	2	6	189911	189916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201515
3280	NC_015945	TGA	2	6	189918	189923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201515
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3282	NC_015945	TGC	2	6	189973	189978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201515
3283	NC_015945	CT	3	6	190081	190086	0 %	50 %	0 %	50 %	344201515
3284	NC_015945	CCT	2	6	190122	190127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201515
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3287	NC_015945	TAG	2	6	190185	190190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201515
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3293	NC_015945	AATG	2	8	190796	190803	50 %	25 %	25 %	0 %	344201516
3294	NC_015945	GAA	2	6	190830	190835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201516
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3319	NC_015945	A	6	6	191726	191731	100 %	0 %	0 %	0 %	344201518
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3323	NC_015945	ACG	2	6	191904	191909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201518
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3329	NC_015945	TA	3	6	192151	192156	50 %	50 %	0 %	0 %	344201519
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3337	NC_015945	GTTT	2	8	192864	192871	0 %	75 %	25 %	0 %	344201520
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3351	NC_015945	A	6	6	193551	193556	100 %	0 %	0 %	0 %	344201522
3352	NC_015945	GCC	2	6	193642	193647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201522
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3358	NC_015945	GAA	2	6	194565	194570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201523
3359	NC_015945	CTTT	2	8	194572	194579	0 %	75 %	0 %	25 %	344201523
3360	NC_015945	ATTA	2	8	194585	194592	50 %	50 %	0 %	0 %	344201523
3361	NC_015945	ATTT	2	8	194594	194601	25 %	75 %	0 %	0 %	344201523
3362	NC_015945	CCA	2	6	194666	194671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201523
3363	NC_015945	TTGA	2	8	194779	194786	25 %	50 %	25 %	0 %	344201523
3364	NC_015945	TAC	2	6	194804	194809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201523
3365	NC_015945	ATC	2	6	194901	194906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201523
3366	NC_015945	T	6	6	195054	195059	0 %	100 %	0 %	0 %	344201524
3367	NC_015945	CAATTT	2	12	195067	195078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	344201524
3368	NC_015945	GTT	2	6	195142	195147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201524
3369	NC_015945	T	8	8	195146	195153	0 %	100 %	0 %	0 %	344201524
3370	NC_015945	TTA	2	6	195267	195272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201524
3371	NC_015945	T	7	7	195273	195279	0 %	100 %	0 %	0 %	344201524
3372	NC_015945	CCTC	2	8	195403	195410	0 %	25 %	0 %	75 %	344201524
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3383	NC_015945	TC	3	6	195915	195920	0 %	50 %	0 %	50 %	344201525
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3485	NC_015945	CCATT	2	10	203086	203095	20 %	40 %	0 %	40 %	344201532
3486	NC_015945	A	6	6	203145	203150	100 %	0 %	0 %	0 %	344201532
3487	NC_015945	A	6	6	203157	203162	100 %	0 %	0 %	0 %	344201532
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3489	NC_015945	TA	3	6	203170	203175	50 %	50 %	0 %	0 %	344201532
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3492	NC_015945	TGA	2	6	203341	203346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201532
3493	NC_015945	AAC	2	6	203353	203358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201532
3494	NC_015945	TAAA	2	8	203526	203533	75 %	25 %	0 %	0 %	344201532
3495	NC_015945	AC	3	6	203652	203657	50 %	0 %	0 %	50 %	344201533
3496	NC_015945	CAA	2	6	203757	203762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201533
3497	NC_015945	ATT	3	9	203774	203782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201533
3498	NC_015945	CAAA	2	8	203790	203797	75 %	0 %	0 %	25 %	344201533
3499	NC_015945	C	6	6	203840	203845	0 %	0 %	0 %	100 %	344201533
3500	NC_015945	A	6	6	203885	203890	100 %	0 %	0 %	0 %	344201533

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